福建中医药大学马克思主义学院院徽以马克思主义书籍为主体造型，寓意学院坚持“固本培元，立德守正”的院训，以习近平新时代中国特色社会主义思想铸魂育人，展开教学与科研工作，落实立德树人根本任务。

1.书籍中引出的字母“M”代指马克思主义理论，三条线条向上延展，分别寓意学院“党建引领强底色、铸魂育人添成色、创新教改增亮色”的教学特色。

2.卷动的线条将院徽组合成太极造型，喻含中医药文化元素；内衬书本，m线条变形，造型寓意层层递进，体现福建中医药大学马克思主义学院以思政引领，服务现代中医药高等教育的理念。

3.标志以圆形反白徽章，深红色为主色，配以毛体，视觉端庄而兼具灵动。